巴蜀中學自2010年推行高中課程改革以來，堅持“積極、務實、有序”的實施策略，成立了重慶市首個校級課程改革指導處（簡稱課改處）；積極開展“131校本課程體系建設”（見2013年3月《課程 教材 教法》7000余字報道），努力探索“三全一自主”的研究性學習實施模式（見2012年12月《綜合實踐活動》）。隨著課程改革的深入推進，學校將改革引入“雷區”——大膽嘗試國家必修課程校本化，通過走班制、小班化，讓學生自主選擇學習內容、自主選擇任課教師，增強了學生學習的主動性，有利于學生個性特長彰顯。

2014-2015學年度，學校在魯能校區高2017級就音樂、信息技術學科開展首輪嘗試。

音樂課程4個選修模塊，即舞蹈（他們和她們：我的第一次舞會）、口琴、演唱教學藝術、小提琴；信息技術3個選修模塊，即編程之美、網絡應用、scratch應用。